39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2951 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  50.41 
 
 		 244 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  51.27 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  48.33 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  38.52 
 
 		 231 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  35.96 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  32.32 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  27.22 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  26.28 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 735 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 875 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  26.06 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  28 
 
 		 814 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  22.95 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  27.18 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  29.17 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 713 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  22.32 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 714 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  27.36 
 
 		 718 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  31.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  36.11 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  24.11 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  24.39 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.96 
 
 		 558 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 488 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  26.26 
 
 		 488 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1019  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0124199  hitchhiker  0.000000321454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  25.25 
 
 		 488 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0774  hypothetical protein  27.83 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  29.47 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  25.25 
 
 		 485 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0439  hypothetical protein  26.26 
 
 		 252 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.0146399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0906  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 244 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000149961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  20.75 
 
 		 357 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>