16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0148 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  74.9 
 
 		 252 aa  352  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2413  hypothetical protein  33.69 
 
 		 209 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.567371  normal  0.121567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4950  hypothetical protein  33.15 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  23.76 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  29.11 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0879  hypothetical protein  32.41 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  33.71 
 
 		 371 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  34.29 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  27.95 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6642  hypothetical protein  32.5 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  36.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>