38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0309 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  940    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1665  hypothetical protein  29.57 
 
 
465 aa  229  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.719067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  27.9 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  23.53 
 
 
252 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  24.14 
 
 
248 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  24.57 
 
 
268 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  25.19 
 
 
231 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  22.35 
 
 
485 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  28 
 
 
246 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  28 
 
 
237 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  28.4 
 
 
235 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  21.76 
 
 
488 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  21.18 
 
 
488 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  27 
 
 
244 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  26.35 
 
 
875 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  21.18 
 
 
488 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  26.55 
 
 
267 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  29.89 
 
 
258 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  35.53 
 
 
308 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  25.99 
 
 
268 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0952  hypothetical protein  26.07 
 
 
258 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00277196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  35.06 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  18.09 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  32.73 
 
 
561 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0879  hypothetical protein  23.23 
 
 
269 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  23.39 
 
 
713 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  23.14 
 
 
243 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  23.39 
 
 
718 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  23.39 
 
 
714 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5107  response regulator receiver protein  23.94 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  38.89 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  29.07 
 
 
232 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  23.84 
 
 
735 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  28.36 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  20.09 
 
 
428 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 
387 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>