53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1324 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  818    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  28.99 
 
 
270 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  27.07 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  27.45 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  27.45 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  27.45 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  24.02 
 
 
273 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  22.71 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  26.5 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  26.64 
 
 
898 aa  70.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4396  response regulator receiver protein  24.45 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4417  response regulator receiver protein  24.45 
 
 
451 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  28.99 
 
 
604 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  28.26 
 
 
592 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4262  response regulator receiver domain-containing protein  24.35 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  30.13 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  28.31 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  25.74 
 
 
266 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  30.8 
 
 
424 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  25.98 
 
 
395 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  31.7 
 
 
438 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  26.16 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  27.82 
 
 
567 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  31.7 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  26.09 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  26.16 
 
 
267 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  28.57 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  26.86 
 
 
366 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  26.55 
 
 
383 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  26.32 
 
 
394 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  23.38 
 
 
875 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  26.87 
 
 
532 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  26.29 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.5 
 
 
2449 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  29.08 
 
 
591 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  26.44 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2577  hypothetical protein  27.35 
 
 
359 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.378417  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1597  hypothetical protein  33.9 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.176083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  28.37 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  27.27 
 
 
600 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  23.66 
 
 
714 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  23.66 
 
 
713 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  21.71 
 
 
597 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  27.06 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  25.33 
 
 
735 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1892  response regulator receiver protein  27.88 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  26.96 
 
 
718 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  40.35 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  21.71 
 
 
405 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1977  response regulator receiver protein  27.88 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  22.47 
 
 
570 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.93 
 
 
427 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  24.82 
 
 
581 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>