41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2313 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  776    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  65.28 
 
 		 561 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  56.5 
 
 		 567 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 604 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  56.19 
 
 		 592 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  48.24 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  52.11 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  52.35 
 
 		 535 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  45.68 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  22.38 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  34.35 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  35.88 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  35.11 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  35.11 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  31.01 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  34.25 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  32.64 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 570 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  28.67 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  26.36 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 597 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  28.87 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  26.36 
 
 		 270 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  28.17 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  25.59 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  29.61 
 
 		 424 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  28.46 
 
 		 600 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  33.04 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  28.12 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  25.6 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  32.17 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4262  response regulator receiver domain-containing protein  29.55 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4417  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4396  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 469 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  38.89 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  27.89 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.89 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  27.48 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>