59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0191 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  100 
 
 		 570 aa  1147    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  94.56 
 
 		 570 aa  1059    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  42.73 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 597 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  43.37 
 
 		 591 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  33.28 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  51.82 
 
 		 407 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  24.03 
 
 		 561 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  32.45 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  29.09 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  29.7 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 567 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  29.7 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  26.94 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 592 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  29.21 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  28.09 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  28.09 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  28.97 
 
 		 394 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  27.91 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  27.7 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  27.27 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  34.19 
 
 		 470 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  34.19 
 
 		 470 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  23.26 
 
 		 273 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  28.24 
 
 		 370 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  25.74 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  25.27 
 
 		 438 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  25.53 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  24.41 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1424  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  34.62 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1412  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4056  hypothetical protein  24.73 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  24.41 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  24.41 
 
 		 366 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4089  hypothetical protein  24.73 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.67 
 
 		 427 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  30.16 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  30.16 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  33.65 
 
 		 470 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 454 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  33.65 
 
 		 470 aa  44.3  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  33.65 
 
 		 470 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  32.89 
 
 		 591 aa  43.9  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 561 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  32.06 
 
 		 566 aa  43.9  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  31.73 
 
 		 469 aa  43.9  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  31.73 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>