33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5619 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  27.47 
 
 
371 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  27.25 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  28.24 
 
 
366 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  28.42 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  26.86 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
567 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  27.43 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  26.86 
 
 
398 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  28.31 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  26.86 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  24.31 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  29.23 
 
 
592 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
604 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  26.82 
 
 
273 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  28.24 
 
 
597 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  32.03 
 
 
591 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  25.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  32.06 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  23.2 
 
 
273 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  29.01 
 
 
600 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 
581 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  24.86 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  29.01 
 
 
570 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  28.24 
 
 
570 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  27.82 
 
 
532 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2402  hypothetical protein  24.87 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  27.13 
 
 
394 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  28.46 
 
 
561 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 
427 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1199  hypothetical protein  27.59 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2668  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 
853 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0795724  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1152  hypothetical protein  26.12 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>