34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2965 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  822    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  57.37 
 
 
591 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  58.87 
 
 
581 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  61.36 
 
 
597 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  50.22 
 
 
570 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  43.94 
 
 
570 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  44.83 
 
 
600 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
567 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  28.95 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  29.15 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
592 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  26.74 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  22.03 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  29.82 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  28.25 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  28.25 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  28.74 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  29.65 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  26.49 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  28.74 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.54 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  26.95 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  32.06 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  26.67 
 
 
532 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 
427 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  27.94 
 
 
535 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  43.4 
 
 
268 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  43.4 
 
 
267 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  43.4 
 
 
266 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  22.67 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  46.3 
 
 
268 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  27.06 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  26.49 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  26.04 
 
 
411 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>