35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0683 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  822    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  29.58 
 
 
424 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  28.11 
 
 
424 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.57 
 
 
438 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  27.3 
 
 
438 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  28.87 
 
 
273 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4056  hypothetical protein  23.96 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4089  hypothetical protein  22.85 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  23.26 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  25.11 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  26.25 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  26.25 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  29.94 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  25.15 
 
 
604 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  25.15 
 
 
592 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  25 
 
 
567 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  25.26 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  24.48 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  24.48 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
570 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  24.14 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  27.09 
 
 
570 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  27.17 
 
 
591 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  22.86 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  28.12 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1863  response regulator receiver protein  24.79 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  27.17 
 
 
597 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1151  response regulator receiver protein  27.5 
 
 
626 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  26.11 
 
 
849 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  27.53 
 
 
532 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  26.63 
 
 
600 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1219  response regulator receiver protein  27 
 
 
625 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  23.7 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  26.5 
 
 
442 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  24.08 
 
 
383 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>