66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2140 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  93.04 
 
 		 273 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  60.73 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  57.51 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  31.8 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  27.6 
 
 		 398 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  27.24 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  26.62 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  28.41 
 
 		 395 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  25.94 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  24.69 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  24.79 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  30.59 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  24.02 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  30.18 
 
 		 592 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  28.19 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 567 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  24.7 
 
 		 898 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  24.58 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  26.25 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  30.18 
 
 		 604 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2402  hypothetical protein  23.55 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 849 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  22.92 
 
 		 383 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  22.79 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  22.82 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  24.05 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  26.63 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4396  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4262  response regulator receiver domain-containing protein  24.53 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  23.63 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  28.68 
 
 		 600 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4417  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 451 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0882  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.280434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  23.21 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  28.46 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  23.2 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  23.5 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1863  response regulator receiver protein  22.38 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 713 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 714 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  22.22 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5251  hypothetical protein  23.19 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  21.03 
 
 		 735 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3914  hypothetical protein  22.3 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  23.35 
 
 		 532 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 875 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  23.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0079  hypothetical protein  26.28 
 
 		 231 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0341416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2577  hypothetical protein  20.38 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.378417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  30 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  21.18 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  20.64 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4089  hypothetical protein  23.58 
 
 		 440 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  24.26 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  23.03 
 
 		 535 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 597 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  23.7 
 
 		 591 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4056  hypothetical protein  24.35 
 
 		 440 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  21.4 
 
 		 438 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  22.86 
 
 		 581 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  22.93 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  22.09 
 
 		 407 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3231  hypothetical protein  21.14 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.218389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>