120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1728 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  100 
 
 		 532 aa  1057    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  47.18 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 567 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  44.87 
 
 		 604 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 592 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  33.82 
 
 		 535 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 332 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  51.45 
 
 		 379 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  55.15 
 
 		 394 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  34.31 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  34.09 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  33.66 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  33.66 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  27.04 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  29.32 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 357 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2034  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792682  normal  0.101595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  26.67 
 
 		 407 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  28.35 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1101 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 570 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  23.34 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 570 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  26.87 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  27.78 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  28 
 
 		 451 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 631 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  27.78 
 
 		 366 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1458 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  27.24 
 
 		 610 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3480  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 228 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000540997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 791 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.07 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.07 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3995  helix-turn-helix, Fis-type  36.96 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0385153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  26.54 
 
 		 277 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  27.82 
 
 		 370 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  23.79 
 
 		 273 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  31.06 
 
 		 638 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 2137 aa  47.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 226 aa  47.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  23.35 
 
 		 273 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 130 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  27.53 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0557  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 125 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  31.01 
 
 		 898 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.44 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 1983 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 139 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 231 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  26.67 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1956  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.942882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  28.41 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  29.29 
 
 		 1188 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2782  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1028  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  24.76 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.070914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.74 
 
 		 230 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 		 948 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1075 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 600 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1214 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 139 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1238 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  29.89 
 
 		 225 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1042  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  26.67 
 
 		 232 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.21 
 
 		 1960 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.34 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1234 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1238 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.18 
 
 		 469 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1238 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  32.95 
 
 		 1392 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 751 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.29 
 
 		 344 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1236 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1236 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  21.25 
 
 		 667 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1236 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  33.93 
 
 		 1970 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 927 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1401  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.78 
 
 		 444 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.6 
 
 		 860 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  21.25 
 
 		 667 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  34.09 
 
 		 368 aa  44.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  30.5 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2401  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 449 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  27.5 
 
 		 1937 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 1937 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  22.78 
 
 		 270 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>