36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0261 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  63.14 
 
 		 591 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 581 aa  1162    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  32.26 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  59.21 
 
 		 407 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  24.15 
 
 		 592 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  24.8 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 604 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  25.95 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  32.56 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  31.98 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  31.98 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  30.32 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  34.25 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  29.34 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  27.54 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  26.95 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  25.75 
 
 		 438 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  31.25 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  23.34 
 
 		 532 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  21.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  44 
 
 		 714 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  44 
 
 		 713 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  44 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  26.24 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  37.04 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  39.62 
 
 		 267 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  23.7 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  39.62 
 
 		 268 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  27.07 
 
 		 451 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.36 
 
 		 560 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00120985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>