39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4338 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  92.86 
 
 		 268 aa  507  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  60.63 
 
 		 266 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  53.53 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  25.1 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  25.21 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  24.17 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  30.9 
 
 		 875 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  24.31 
 
 		 718 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  23.76 
 
 		 714 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 735 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  26.16 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3914  hypothetical protein  24.1 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  26.79 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  29.67 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  26.55 
 
 		 480 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  25.39 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  25.75 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  25.68 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0774  hypothetical protein  24.16 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  32.98 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  43.4 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  29.73 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  31.96 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3231  hypothetical protein  23.68 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.218389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  39.62 
 
 		 581 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  26.35 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  27.67 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  39.62 
 
 		 591 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  41.51 
 
 		 600 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  29.47 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  23.85 
 
 		 357 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  24.82 
 
 		 558 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 597 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>