21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1950 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  373  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0879  hypothetical protein  38.33 
 
 		 269 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  23.5 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  25.68 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1665  hypothetical protein  30.95 
 
 		 465 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.719067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  30 
 
 		 488 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 488 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  25.57 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  25.51 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  30 
 
 		 488 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  27.72 
 
 		 246 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0449  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 		 265 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 485 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  26.09 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  28.57 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  27.91 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  36.21 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>