39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0343 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  48.18 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  48.33 
 
 		 243 aa  228  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  48.75 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  37.71 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  33.88 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  37 
 
 		 528 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.09 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 814 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 875 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 488 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  29.55 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  28 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 735 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 389 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 714 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 713 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 718 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  30.91 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  23.01 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  21.76 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0906  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000149961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  29.33 
 
 		 468 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.96 
 
 		 558 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  21.18 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  28.07 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  27.72 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  24.24 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0774  hypothetical protein  27.73 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  27.07 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  24.75 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1665  hypothetical protein  23.53 
 
 		 465 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.719067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>