37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2641 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  63.93 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  49.8 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  48.18 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  38.82 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  36.11 
 
 		 371 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  25.14 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  27.06 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 814 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 735 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 485 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 875 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  30 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 718 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  29.44 
 
 		 713 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  24.85 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  25.15 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  27 
 
 		 480 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  28.83 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  30.77 
 
 		 558 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 389 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 387 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  35 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  32.98 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6642  hypothetical protein  27.71 
 
 		 306 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  31.91 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  31.63 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>