49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2371 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 387 aa  790    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  37 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  31.2 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 875 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  34.55 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.17 
 
 		 171 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  29 
 
 		 265 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  32.46 
 
 		 158 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 248 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  28 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  29.52 
 
 		 322 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 735 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 714 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 161 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.26 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  28.16 
 
 		 718 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 713 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  34.18 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  24.39 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  25.81 
 
 		 258 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  25.47 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.68 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0774  hypothetical protein  33.02 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.08 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  30.69 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  26.89 
 
 		 169 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  24.75 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.1 
 
 		 154 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 488 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  24.04 
 
 		 244 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  28 
 
 		 308 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>