36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0201 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  92.86 
 
 		 267 aa  507  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  57.36 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  53.94 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  24.79 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  25.21 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  24.69 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 875 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  24.51 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  23.76 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 735 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 714 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  23.76 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  37 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  26.16 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3914  hypothetical protein  24.51 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  25.91 
 
 		 232 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  28.02 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  25.99 
 
 		 480 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  43.4 
 
 		 407 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  29.46 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  25.57 
 
 		 190 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3231  hypothetical protein  23.68 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.218389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  25.42 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  31.91 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  27.07 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  41.51 
 
 		 600 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  39.62 
 
 		 581 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  39.62 
 
 		 591 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  27.45 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0774  hypothetical protein  23.6 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  30.93 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.54 
 
 		 558 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>