20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3914 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3231  hypothetical protein  66.14 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.218389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  30.05 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  24.1 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  23.27 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  22.22 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  24.51 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  22.11 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  28.18 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  23.89 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  28.97 
 
 		 718 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 735 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 714 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 713 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  25.96 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  24.34 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 488 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 488 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 485 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>