17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0476 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  74.9 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2413  hypothetical protein  34.08 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.567371  normal  0.121567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4950  hypothetical protein  35.75 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  32.04 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  23.53 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  28.18 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  29.67 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  28.02 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0879  hypothetical protein  32.69 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  32.58 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  32.86 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0449  hypothetical protein  33.65 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  25.16 
 
 		 468 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1271  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.19 
 
 		 655 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3276  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  50 
 
 		 680 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0172057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>