38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1395 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1220    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 597 aa  300  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  33.84 
 
 		 591 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  32.49 
 
 		 581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  33.5 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  44.83 
 
 		 407 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  30.73 
 
 		 379 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  30.85 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  32.75 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  32.16 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  32.16 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  28.36 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  30.54 
 
 		 424 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  30.41 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  27.49 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  26.32 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.49 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  31.58 
 
 		 371 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  29.01 
 
 		 370 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  28.78 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  23.84 
 
 		 273 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  28.46 
 
 		 394 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  27.82 
 
 		 273 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  26.32 
 
 		 273 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  29.46 
 
 		 366 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  27.74 
 
 		 366 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  25.95 
 
 		 270 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  25.7 
 
 		 411 aa  47.4  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  27.69 
 
 		 428 aa  47  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 532 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  22.94 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  25 
 
 		 535 aa  44.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  24.55 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  40.74 
 
 		 266 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  41.51 
 
 		 268 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>