44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0173 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  94.56 
 
 		 570 aa  1059    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  100 
 
 		 570 aa  1147    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  43.88 
 
 		 581 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 597 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  43.34 
 
 		 591 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  32.94 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  50.91 
 
 		 407 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  24.39 
 
 		 561 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  32.73 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 592 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  28.48 
 
 		 424 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  29.09 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  26.63 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  29.09 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  27.53 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  26.4 
 
 		 398 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  28.97 
 
 		 394 aa  57  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  26.4 
 
 		 398 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  27.09 
 
 		 411 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  26.37 
 
 		 395 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  29.01 
 
 		 370 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  25.27 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  23.26 
 
 		 273 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  27.94 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 604 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  32.48 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  32.48 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4089  hypothetical protein  24.73 
 
 		 440 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  25.2 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  24.11 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  25.2 
 
 		 366 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  25.2 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  32.82 
 
 		 566 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 591 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 643 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 332 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  31.62 
 
 		 470 aa  43.9  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  31.03 
 
 		 218 aa  43.9  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>