More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2224 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2224  response regulator  100 
 
 		 561 aa  1112    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  58.79 
 
 		 567 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  52.71 
 
 		 604 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  52.61 
 
 		 592 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  47.18 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  41.73 
 
 		 535 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  65.28 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  42.94 
 
 		 332 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  52.75 
 
 		 379 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  24.8 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  22.96 
 
 		 591 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  23.95 
 
 		 570 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  24.31 
 
 		 570 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  36.84 
 
 		 395 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  37.43 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  28.95 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  36.84 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  36.84 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  32.02 
 
 		 273 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  31.76 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  29.35 
 
 		 270 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  30.59 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  28.25 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 597 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  32.35 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  32.35 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  31.16 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  30.6 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  31.16 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  31.18 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  25.93 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  26.06 
 
 		 366 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 686 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.62 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  34.67 
 
 		 841 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  33.04 
 
 		 451 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 738 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  54.7  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  34.19 
 
 		 841 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 393 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.84 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  25.53 
 
 		 366 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  37.17 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.17 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 768 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.96 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  32.69 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1538  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.970597  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  35.59 
 
 		 769 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.51 
 
 		 834 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1717  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  30.33 
 
 		 570 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 771 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.31 
 
 		 464 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 771 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 772 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 771 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 771 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 771 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  31.9 
 
 		 322 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 705 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 316 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 688 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  30.08 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 955 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 466 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.634231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2009  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 860 aa  50.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 487 aa  50.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 		 371 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2461  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3040  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 131 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.638126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 1013 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  32.12 
 
 		 858 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  30.36 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.14 
 
 		 473 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.14 
 
 		 473 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 139 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 955 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 139 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  30.7 
 
 		 872 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 927 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  35 
 
 		 368 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38278  predicted protein  31.93 
 
 		 145 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  32.73 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  32.58 
 
 		 742 aa  48.5  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 656 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1012 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>