53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0309 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  775    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  60.42 
 
 		 604 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  69.07 
 
 		 592 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  61.5 
 
 		 567 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  52.75 
 
 		 561 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  51.45 
 
 		 532 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  46.19 
 
 		 394 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  31.25 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  31.05 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  35.29 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  33.53 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  29.29 
 
 		 591 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  30.73 
 
 		 600 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  29.15 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  30.12 
 
 		 535 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  25.95 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  26.63 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0190  Zinc finger-domain-containing protein  28.65 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0243278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  27.86 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  29.14 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  26.19 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  28.31 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2279  MJ0042 family finger-like protein  27.53 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  25.26 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  25.81 
 
 		 438 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  26.09 
 
 		 428 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  24.1 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  24.1 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4056  hypothetical protein  24.59 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4089  hypothetical protein  25.27 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  25.93 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  22.89 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  24.65 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  28.47 
 
 		 898 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  24.29 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.98 
 
 		 560 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00120985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5887  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 		 762 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  27.42 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 849 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4262  response regulator receiver domain-containing protein  23.03 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4417  response regulator receiver protein  23.03 
 
 		 451 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4396  response regulator receiver protein  22.35 
 
 		 469 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1977  response regulator receiver protein  26 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  25.51 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1892  response regulator receiver protein  26 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>