40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2030 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  100 
 
 
597 aa  1224    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  44.73 
 
 
591 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  43.42 
 
 
581 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  43.46 
 
 
570 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  43.25 
 
 
570 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  31.36 
 
 
600 aa  301  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  54.19 
 
 
407 aa  231  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  21.22 
 
 
604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  28.98 
 
 
567 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  27.32 
 
 
592 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  28.74 
 
 
424 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  25.97 
 
 
379 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  28.14 
 
 
424 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  28.09 
 
 
398 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  28.74 
 
 
438 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  27.87 
 
 
561 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  28.09 
 
 
398 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  28.09 
 
 
398 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
532 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  28.74 
 
 
438 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  28.09 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  25.58 
 
 
273 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  28.23 
 
 
332 aa  57.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  27.91 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  28.24 
 
 
370 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  24.86 
 
 
394 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 
427 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  27.13 
 
 
426 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  27.13 
 
 
425 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  26.35 
 
 
535 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  27.17 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  27.03 
 
 
383 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  27.03 
 
 
366 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  32.32 
 
 
866 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  27.03 
 
 
366 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  23.02 
 
 
428 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 
427 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  28.57 
 
 
479 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  25.6 
 
 
898 aa  43.9  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  23.7 
 
 
714 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>