162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4274 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 479 aa  950    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  31.85 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  35.67 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  35.67 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  34.72 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  35.9 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  34.03 
 
 		 345 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  37.18 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  37.36 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 787 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  36.11 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 574 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  27.81 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  31.39 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  30.94 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 571 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.39 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.39 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 637 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  30.22 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.93 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  31.91 
 
 		 866 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.78 
 
 		 568 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 573 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  27.62 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.34 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  36.3 
 
 		 182 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  31.16 
 
 		 768 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  30.66 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  31.98 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  31.13 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  32.87 
 
 		 587 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  35.56 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  34.81 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  28.47 
 
 		 871 aa  67  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  35.66 
 
 		 610 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.5 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  29.49 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.5 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.94 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.66 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.34 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  31.43 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  32.61 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  28.9 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 891 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 885 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.06 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  28.86 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  28.26 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  29.79 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  35.2 
 
 		 578 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  29.71 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  28.47 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  29.2 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  30.17 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  31.25 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  29.31 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  31.9 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  30.94 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  44.62 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  27.27 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  28.47 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  26.8 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  33.8 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  30.5 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  32.64 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  31.43 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  27.34 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  23.4 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  31.72 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  33.33 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  31.03 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 586 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 586 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 586 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 586 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0270  general secretion pathway protein E  28.78 
 
 		 677 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156539  normal  0.222382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>