223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3615 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 368 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  32.98 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  30.81 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  34.77 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  33.07 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  32.4 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  32.98 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  31.84 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  30.75 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.96 
 
 		 566 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 564 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  30.99 
 
 		 571 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  36.11 
 
 		 558 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.82 
 
 		 555 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 553 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 553 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.33 
 
 		 563 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.41 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  33.78 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  31.37 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  38.73 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  38.46 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 568 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3077  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly  26.11 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0718124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.71 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  36.43 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.03 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.03 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.81 
 
 		 568 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 570 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  33.81 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.93 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.25 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 558 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  33.78 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  34.56 
 
 		 871 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  31.43 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.14 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.14 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  35.97 
 
 		 841 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  32.61 
 
 		 582 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  32.85 
 
 		 562 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  36.5 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  32.12 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  34.42 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  27.86 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  34.29 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  34.56 
 
 		 866 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 787 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  33.9 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  32.61 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  34.35 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  30.63 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  33.05 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 599 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 553 aa  69.7  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  33.57 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  30.77 
 
 		 552 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  34.06 
 
 		 599 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  34.06 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  30.94 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  34.31 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  33.81 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  31.61 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  36.09 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  28.87 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  29.29 
 
 		 612 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  28.28 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  23.38 
 
 		 768 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  26.61 
 
 		 576 aa  66.6  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 567 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  28.21 
 
 		 570 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  36.09 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  33.58 
 
 		 561 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  31.34 
 
 		 578 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  31.39 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  34.04 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  32.41 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.35 
 
 		 698 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>