161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1347 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 
426 aa  801    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  96.71 
 
 
425 aa  731    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  60.75 
 
 
451 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  31.86 
 
 
385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  31.8 
 
 
387 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  25.62 
 
 
378 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  40.94 
 
 
370 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  41.72 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  28.11 
 
 
479 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  35.51 
 
 
345 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  38.8 
 
 
345 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  35.77 
 
 
566 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  29.54 
 
 
768 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  36.23 
 
 
553 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  33.81 
 
 
568 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  32.64 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.65 
 
 
568 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  30 
 
 
571 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  33.09 
 
 
568 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.09 
 
 
568 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.85 
 
 
563 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.09 
 
 
568 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.09 
 
 
568 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.5 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.37 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.37 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
547 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.06 
 
 
568 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  36.22 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  34.25 
 
 
610 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  32.05 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  30.5 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 
506 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  27.14 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.43 
 
 
834 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  40.43 
 
 
841 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 
499 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.71 
 
 
558 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0270  general secretion pathway protein E  41.55 
 
 
677 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156539  normal  0.222382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  33.56 
 
 
592 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
573 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
553 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  30.61 
 
 
553 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  32.89 
 
 
604 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  33.82 
 
 
561 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  29.94 
 
 
571 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  30.61 
 
 
568 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  28.49 
 
 
554 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
888 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  30.05 
 
 
573 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.68 
 
 
571 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  38.17 
 
 
181 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  28.03 
 
 
885 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  33.11 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  28.67 
 
 
570 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  35.11 
 
 
182 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
787 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  29.5 
 
 
244 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
564 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  31.54 
 
 
574 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  36.64 
 
 
181 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  30.97 
 
 
569 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  28.07 
 
 
552 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  30.5 
 
 
871 aa  60.1  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  31.25 
 
 
577 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  32.45 
 
 
573 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  35.9 
 
 
841 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
591 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  27.86 
 
 
280 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.28 
 
 
698 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  26.49 
 
 
576 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  24.03 
 
 
567 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  28.78 
 
 
277 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  25 
 
 
564 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  34.15 
 
 
557 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  25 
 
 
562 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  27.86 
 
 
280 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  27.69 
 
 
558 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  26.32 
 
 
552 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  31.86 
 
 
567 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  31.62 
 
 
891 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  33.09 
 
 
866 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  27.74 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  30.22 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  24.31 
 
 
563 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.56 
 
 
569 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  32.68 
 
 
688 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  30.71 
 
 
574 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2692  chromosome segregation ATPases-like  42.05 
 
 
1018 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  31.88 
 
 
841 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  30.71 
 
 
549 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 
277 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
557 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  36.67 
 
 
569 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  27.66 
 
 
806 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  31.16 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  29.45 
 
 
568 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  29.71 
 
 
612 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>