50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0270 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0270  general secretion pathway protein E  100 
 
 
677 aa  1258    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156539  normal  0.222382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  70 
 
 
841 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  71.67 
 
 
834 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  70.56 
 
 
841 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  30.04 
 
 
768 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  27.08 
 
 
385 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  28.02 
 
 
370 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  26.35 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  24.35 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  41.55 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  29.05 
 
 
345 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  29.05 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  41.55 
 
 
425 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  30.28 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  29.25 
 
 
479 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  28.3 
 
 
378 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  34.15 
 
 
451 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  29.58 
 
 
571 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  30.2 
 
 
592 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  25.89 
 
 
368 aa  54.3  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  29.53 
 
 
604 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.54 
 
 
568 aa  53.9  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  26.67 
 
 
244 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  26.47 
 
 
566 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  27.55 
 
 
556 aa  51.2  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  30.67 
 
 
561 aa  50.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  30.07 
 
 
610 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  26.92 
 
 
553 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  21.86 
 
 
562 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  26.95 
 
 
564 aa  48.9  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.61 
 
 
571 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  24.09 
 
 
567 aa  49.3  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  25.36 
 
 
568 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 
568 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  24.29 
 
 
568 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  21.83 
 
 
563 aa  47.4  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
885 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.29 
 
 
568 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.29 
 
 
568 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  25.6 
 
 
555 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  25.62 
 
 
568 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  27.45 
 
 
567 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  24.64 
 
 
552 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  20.83 
 
 
576 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  25.93 
 
 
785 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  29.29 
 
 
866 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3077  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly  22.6 
 
 
350 aa  45.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0718124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  38.81 
 
 
569 aa  44.3  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  31.25 
 
 
561 aa  43.9  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>