241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0022 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.14 
 
 		 554 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.24 
 
 		 563 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  36.13 
 
 		 566 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  40.82 
 
 		 499 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  40.85 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  40.82 
 
 		 506 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  40.85 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  40 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  34.29 
 
 		 562 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  34.29 
 
 		 563 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  40.14 
 
 		 181 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 553 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 568 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.32 
 
 		 568 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.32 
 
 		 568 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.32 
 
 		 568 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 564 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.92 
 
 		 568 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.33 
 
 		 571 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.03 
 
 		 568 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.8 
 
 		 568 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 787 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 555 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.92 
 
 		 568 aa  91.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.92 
 
 		 568 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  33.8 
 
 		 568 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 571 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  34.53 
 
 		 573 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.17 
 
 		 558 aa  89  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 570 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 553 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 568 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 547 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  32.39 
 
 		 568 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1868  putative type IV pilin  36.36 
 
 		 199 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 553 aa  85.1  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  35.51 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  34.78 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  40.15 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 577 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 587 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 571 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 885 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  35.29 
 
 		 557 aa  82  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 586 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.76 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  34.53 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 564 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  30.43 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  32.37 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  40.91 
 
 		 578 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  32.06 
 
 		 561 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 567 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 585 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  31.25 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  35.25 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  33.57 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 568 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  32.62 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 586 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  37.72 
 
 		 584 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  30.6 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  30.18 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  38.79 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 554 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  30.77 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 591 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  31.55 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  33.33 
 
 		 1017 aa  72  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  34.21 
 
 		 587 aa  72  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  27.97 
 
 		 563 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 888 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  33.58 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  33.93 
 
 		 570 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 576 aa  69.3  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  30.59 
 
 		 891 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  37.27 
 
 		 589 aa  68.6  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  29.5 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  29.93 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  37.8 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.06 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 569 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  33.94 
 
 		 552 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>