187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1868 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1868  putative type IV pilin  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 571 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  33.9 
 
 		 558 aa  104  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.5 
 
 		 563 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.29 
 
 		 566 aa  98.6  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 553 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.19 
 
 		 568 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  32.7 
 
 		 562 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.21 
 
 		 787 aa  92  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  30.56 
 
 		 563 aa  91.3  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.93 
 
 		 568 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.5 
 
 		 568 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 568 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 568 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  29.89 
 
 		 564 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.62 
 
 		 568 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.81 
 
 		 568 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 554 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 561 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.92 
 
 		 568 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  36.36 
 
 		 244 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.92 
 
 		 568 aa  85.5  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 558 aa  85.5  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  33.8 
 
 		 378 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 559 aa  85.1  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 571 aa  84.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  35.92 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  35.76 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 688 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 587 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.92 
 
 		 568 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 573 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.37 
 
 		 571 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  35.86 
 
 		 553 aa  82  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 570 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  33.1 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  34.51 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.59 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  34.51 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.17 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.51 
 
 		 557 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  30.46 
 
 		 568 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  32.94 
 
 		 499 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  32.35 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  32.94 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.99 
 
 		 568 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  34.03 
 
 		 574 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  32.24 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  32.43 
 
 		 563 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 556 aa  74.7  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 891 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  31.69 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  35.37 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  32.41 
 
 		 561 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  30.99 
 
 		 391 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  34.45 
 
 		 587 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 558 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  29.89 
 
 		 553 aa  71.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  27.96 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  29.58 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 577 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 585 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  34.35 
 
 		 574 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  27.44 
 
 		 612 aa  68.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  32 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  34.45 
 
 		 570 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 567 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  28.28 
 
 		 577 aa  68.2  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  33.8 
 
 		 550 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  33.09 
 
 		 885 aa  67.8  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  30.72 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  29.86 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  30.99 
 
 		 594 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  30.43 
 
 		 577 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 576 aa  66.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 584 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  29.29 
 
 		 561 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  30.07 
 
 		 574 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 554 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  36.5 
 
 		 578 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 568 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 554 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 806 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 586 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  26.03 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  32.41 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 561 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  30.99 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 568 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  29.14 
 
 		 823 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>