141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4032 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  100 
 
 
478 aa  871    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  98.92 
 
 
499 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  98.39 
 
 
506 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  40.82 
 
 
244 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.44 
 
 
568 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  33.76 
 
 
568 aa  86.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.16 
 
 
553 aa  86.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.69 
 
 
568 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  35.03 
 
 
566 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.44 
 
 
568 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.26 
 
 
563 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.21 
 
 
568 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.95 
 
 
568 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  40.58 
 
 
564 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 
568 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.65 
 
 
568 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 
568 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
568 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  35.92 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  36.62 
 
 
181 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  39.67 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  37.06 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  31.47 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.4 
 
 
571 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
573 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  34.04 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  34.75 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  38.84 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  36.24 
 
 
553 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  32.67 
 
 
564 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  32.91 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
568 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  29.32 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  31.01 
 
 
563 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  38.13 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.68 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  33.56 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.86 
 
 
571 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
573 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  30.64 
 
 
559 aa  73.2  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  33.77 
 
 
688 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  35 
 
 
557 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  32.61 
 
 
561 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
568 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  29.27 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  31.51 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  31.21 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1868  putative type IV pilin  33.11 
 
 
199 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  30.3 
 
 
577 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
561 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
787 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  31.21 
 
 
280 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  34.11 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  31.21 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  30.3 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  33.51 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  34.45 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.29 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  32.62 
 
 
557 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  29.23 
 
 
561 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  30.72 
 
 
553 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  36.52 
 
 
556 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  29.61 
 
 
554 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  31.51 
 
 
574 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
560 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  32.39 
 
 
552 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
570 aa  64.3  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
558 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  32.67 
 
 
571 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  35.04 
 
 
563 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  31.76 
 
 
570 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  32.39 
 
 
552 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  36.43 
 
 
841 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  38.66 
 
 
578 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  27.46 
 
 
280 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  29.14 
 
 
577 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  29.94 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  35.37 
 
 
561 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  32.54 
 
 
871 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  31.41 
 
 
594 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
292 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
586 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  33.81 
 
 
591 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  28.98 
 
 
885 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  33.81 
 
 
549 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  31.15 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  33.06 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  32.03 
 
 
637 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  37.4 
 
 
587 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  31.51 
 
 
574 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
558 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  35.59 
 
 
570 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  29.8 
 
 
426 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  38.84 
 
 
578 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
292 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  34.45 
 
 
554 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>