61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3077 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3077  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly  100 
 
 		 350 aa  700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0718124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  27.47 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  28.76 
 
 		 385 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  28.61 
 
 		 367 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  28.83 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  29 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  28.28 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  27.61 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  27.04 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  25.6 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  32.21 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  36.73 
 
 		 577 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  28.28 
 
 		 568 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  30.15 
 
 		 587 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.72 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  24.38 
 
 		 866 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.83 
 
 		 568 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  25.83 
 
 		 568 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.83 
 
 		 568 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  28.47 
 
 		 568 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  29.49 
 
 		 479 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.65 
 
 		 568 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  27.08 
 
 		 566 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.5 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  36.56 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 586 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  26.47 
 
 		 586 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  25.56 
 
 		 561 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  23.81 
 
 		 576 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  27.03 
 
 		 574 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  28.1 
 
 		 558 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.37 
 
 		 568 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 599 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  28.3 
 
 		 599 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  28.3 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 574 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  26.62 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  29.46 
 
 		 582 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.48 
 
 		 568 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.48 
 
 		 568 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  24.83 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  24.83 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  23.32 
 
 		 644 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 584 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 806 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  28.67 
 
 		 574 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  24.48 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  26.47 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  25.77 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  30 
 
 		 586 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  28.47 
 
 		 567 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  28.57 
 
 		 768 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  27.34 
 
 		 637 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 570 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 589 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.31 
 
 		 568 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 561 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  32.99 
 
 		 578 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 891 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>