70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3723 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 866 aa  1706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  36.96 
 
 		 391 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  36.23 
 
 		 387 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  33.57 
 
 		 367 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  34.78 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  31.97 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  31.97 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  30.28 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  33.82 
 
 		 566 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  31.91 
 
 		 479 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  29.79 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.82 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.82 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.82 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.53 
 
 		 568 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  29.85 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.62 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  33.07 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  31.62 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.26 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.86 
 
 		 571 aa  60.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  32 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.2 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.2 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 555 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  28.38 
 
 		 559 aa  57  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 569 aa  55.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.71 
 
 		 568 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3077  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly  24.22 
 
 		 350 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0718124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.08 
 
 		 568 aa  55.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  26.47 
 
 		 553 aa  55.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  32.64 
 
 		 426 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 561 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  26.28 
 
 		 570 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1868  putative type IV pilin  29.77 
 
 		 199 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  32.05 
 
 		 552 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 561 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  26.21 
 
 		 573 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  25.55 
 
 		 568 aa  52.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  32.37 
 
 		 425 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 553 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  25 
 
 		 567 aa  52  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  28.37 
 
 		 244 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  24.83 
 
 		 576 aa  48.9  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 589 aa  48.9  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  31.03 
 
 		 578 aa  48.5  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 637 aa  48.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  29.45 
 
 		 591 aa  47.8  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  24.26 
 
 		 562 aa  47.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  30.13 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  24.26 
 
 		 563 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  31.29 
 
 		 549 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 561 aa  47  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 597 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  29.05 
 
 		 891 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  24.09 
 
 		 573 aa  46.2  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.64 
 
 		 558 aa  45.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  32.72 
 
 		 550 aa  45.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  26.39 
 
 		 574 aa  45.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  27.13 
 
 		 557 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  24.26 
 
 		 564 aa  45.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  28.03 
 
 		 552 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  23.68 
 
 		 451 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 547 aa  45.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  29.29 
 
 		 578 aa  44.3  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 570 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>