More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4273 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 552 aa  1116    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  53.36 
 
 		 552 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  52.81 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  51.18 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3401  general secretory system II, protein E-like  50.09 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3220  General secretory system II protein E domain protein  47.71 
 
 		 550 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  46.2 
 
 		 550 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  24.73 
 
 		 564 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  25.59 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  26 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  26.53 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.32 
 
 		 558 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  24.69 
 
 		 568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 589 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  27.64 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  25.41 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  23.67 
 
 		 571 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  24.45 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  23.7 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  24.77 
 
 		 558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  24.58 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  25.18 
 
 		 568 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  25.89 
 
 		 556 aa  156  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  24.77 
 
 		 557 aa  156  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  24.19 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  22.02 
 
 		 570 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  25.36 
 
 		 568 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  23.41 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  23.78 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  24.22 
 
 		 571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  22.74 
 
 		 787 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.28 
 
 		 568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  25.49 
 
 		 637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  24.95 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  23.65 
 
 		 557 aa  148  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  24.15 
 
 		 586 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  23.78 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.28 
 
 		 571 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.7 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.7 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  22.12 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  24.56 
 
 		 568 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  22.66 
 
 		 568 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  24.28 
 
 		 554 aa  144  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  21.92 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  25.05 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  22.9 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.1 
 
 		 568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  25 
 
 		 585 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  25.05 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  23.15 
 
 		 566 aa  140  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  22.96 
 
 		 585 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  23.74 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  23.52 
 
 		 569 aa  140  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  23.75 
 
 		 565 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  24.27 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  24.42 
 
 		 574 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  24.24 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  23.56 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  23.56 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  23.74 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.98 
 
 		 568 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  21.96 
 
 		 806 aa  137  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  23.52 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  22.77 
 
 		 567 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  23.88 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  23.88 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  23.2 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  22.74 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  23.38 
 
 		 586 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  23.28 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  24.68 
 
 		 559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.52 
 
 		 568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  24.15 
 
 		 571 aa  134  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  23.49 
 
 		 599 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  23.3 
 
 		 560 aa  133  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  23.45 
 
 		 599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  20.73 
 
 		 871 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  22.75 
 
 		 558 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  23.75 
 
 		 599 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  21.74 
 
 		 561 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  22.18 
 
 		 594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.38 
 
 		 568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  21.7 
 
 		 565 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  21.56 
 
 		 563 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  23.53 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.94 
 
 		 568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  23.41 
 
 		 587 aa  127  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  22.83 
 
 		 578 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  21.18 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  21.48 
 
 		 823 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  22.66 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  22.73 
 
 		 603 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  21.82 
 
 		 885 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  22.55 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  22.24 
 
 		 568 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  22.61 
 
 		 575 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  22.63 
 
 		 561 aa  123  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  23.01 
 
 		 891 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  22.28 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>