37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0231 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1175    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  63.14 
 
 		 581 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  44.73 
 
 		 597 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  43.61 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  33.84 
 
 		 600 aa  294  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  61.47 
 
 		 407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  22.96 
 
 		 561 aa  97.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 567 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 604 aa  87.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  29.29 
 
 		 379 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  28.49 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  31.75 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  32.95 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  32.95 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  29.34 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  28.14 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  29.61 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  28.74 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.54 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  32.64 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  25.67 
 
 		 332 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  32.03 
 
 		 370 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 427 aa  54.3  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  27.17 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  29.08 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  29.45 
 
 		 866 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.13 
 
 		 560 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00120985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  26.87 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  25.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  22.09 
 
 		 273 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  39.62 
 
 		 267 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  39.62 
 
 		 268 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 714 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>