67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0270 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 841 aa  1549    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  97.74 
 
 		 841 aa  1050    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  97.77 
 
 		 834 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0270  general secretion pathway protein E  60.92 
 
 		 677 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156539  normal  0.222382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  26.74 
 
 		 768 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  34.01 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  28.57 
 
 		 345 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  32.61 
 
 		 367 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  26.79 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  26.45 
 
 		 385 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  27.53 
 
 		 571 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  33.79 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  35.77 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  31.07 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  33.1 
 
 		 425 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  28.86 
 
 		 244 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  34.67 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 592 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 567 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  28.99 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  27.21 
 
 		 378 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  30.53 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.26 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  29.29 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  30.11 
 
 		 553 aa  57  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.09 
 
 		 568 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 554 aa  56.6  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  23.18 
 
 		 787 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  29.29 
 
 		 506 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  28.26 
 
 		 391 aa  55.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 553 aa  55.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  29.29 
 
 		 499 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 806 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 		 563 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 		 568 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  25.74 
 
 		 566 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  25 
 
 		 568 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 		 568 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  28.06 
 
 		 610 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  25 
 
 		 885 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  25.9 
 
 		 555 aa  51.2  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  29.48 
 
 		 394 aa  50.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  33.33 
 
 		 182 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  18.44 
 
 		 563 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  30 
 
 		 181 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.32 
 
 		 1148 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  25.2 
 
 		 558 aa  48.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  30 
 
 		 181 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 891 aa  48.1  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  23.36 
 
 		 567 aa  47.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  23.57 
 
 		 573 aa  47.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  29.29 
 
 		 559 aa  47.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  37.78 
 
 		 578 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  29.66 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  28.66 
 
 		 823 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  21.58 
 
 		 571 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.32 
 
 		 958 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  25 
 
 		 888 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  44.29 
 
 		 315 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  29.08 
 
 		 574 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1241  nitrite reductase related protein  42.68 
 
 		 349 aa  45.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0270743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  29.82 
 
 		 541 aa  45.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.43 
 
 		 395 aa  44.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 571 aa  44.3  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3077  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly  26.22 
 
 		 350 aa  44.3  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0718124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>