176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0508 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 698 aa  1432    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  57.75 
 
 		 653 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  80.7 
 
 		 703 aa  1174    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  80.7 
 
 		 703 aa  1174    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.63 
 
 		 706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.66 
 
 		 706 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.01 
 
 		 713 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  47.83 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.46 
 
 		 715 aa  472  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.26 
 
 		 736 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  39.71 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.71 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.71 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.87 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.13 
 
 		 724 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.47 
 
 		 724 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.99 
 
 		 724 aa  343  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.57 
 
 		 724 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.46 
 
 		 497 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  38 
 
 		 502 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.79 
 
 		 502 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.51 
 
 		 711 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  31.88 
 
 		 542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.82 
 
 		 488 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.26 
 
 		 442 aa  210  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.77 
 
 		 670 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.02 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  30 
 
 		 442 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  34.71 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 574 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 553 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  28.03 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  28.03 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  28.68 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 275 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 283 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.6 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  28.36 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  27.04 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  27.61 
 
 		 567 aa  62  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  30.05 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  28 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.14 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 569 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 561 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  28.82 
 
 		 552 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  26.22 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  28.24 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  38.28 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  30.56 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  27.54 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  25.56 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  25.68 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  32.26 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  27.87 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  34.27 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  35.59 
 
 		 367 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  30.07 
 
 		 181 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0872  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway PilB-like  26.89 
 
 		 548 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.97 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  31.3 
 
 		 555 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  30.56 
 
 		 576 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.53 
 
 		 553 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  37.5 
 
 		 425 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  28.35 
 
 		 568 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  34.75 
 
 		 345 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  30.83 
 
 		 582 aa  55.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.35 
 
 		 568 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.35 
 
 		 568 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  26.95 
 
 		 552 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  30.51 
 
 		 563 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.47 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  34.27 
 
 		 506 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 558 aa  55.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  34.21 
 
 		 612 aa  55.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  32.5 
 
 		 368 aa  55.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  29.11 
 
 		 182 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  33.9 
 
 		 345 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 888 aa  54.7  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  28.67 
 
 		 181 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  34.51 
 
 		 478 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.63 
 
 		 553 aa  53.9  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.71 
 
 		 871 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  30.95 
 
 		 370 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.35 
 
 		 568 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>