82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1600 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 
711 aa  1451    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  36.62 
 
 
542 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.76 
 
 
670 aa  270  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.14 
 
 
698 aa  224  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  30.33 
 
 
745 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.33 
 
 
745 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.33 
 
 
745 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.41 
 
 
745 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.71 
 
 
713 aa  210  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.75 
 
 
703 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.75 
 
 
703 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.88 
 
 
736 aa  204  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.69 
 
 
715 aa  203  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.77 
 
 
724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.66 
 
 
573 aa  184  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.95 
 
 
442 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.22 
 
 
724 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  27.63 
 
 
706 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  27.57 
 
 
653 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  31.25 
 
 
442 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.06 
 
 
706 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.81 
 
 
497 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.24 
 
 
724 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.79 
 
 
724 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.81 
 
 
502 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.2 
 
 
502 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.38 
 
 
488 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.33 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  30.56 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 
415 aa  60.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  22.44 
 
 
420 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
425 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  28.36 
 
 
567 aa  55.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  28.24 
 
 
841 aa  54.7  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  26.47 
 
 
566 aa  54.3  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  31.91 
 
 
578 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  26.39 
 
 
577 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  31.25 
 
 
891 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  31.43 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
418 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  22.43 
 
 
664 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
461 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
553 aa  51.6  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.84 
 
 
553 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  29.2 
 
 
559 aa  49.7  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  29.52 
 
 
610 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  27.86 
 
 
576 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33.61 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.65 
 
 
466 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  36.63 
 
 
737 aa  48.5  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.89 
 
 
466 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
437 aa  47.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  27.22 
 
 
578 aa  47.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  24.81 
 
 
385 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
495 aa  47.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  29.29 
 
 
577 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  27.59 
 
 
573 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  25.74 
 
 
612 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
537 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  25.5 
 
 
577 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  24.65 
 
 
582 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  32.77 
 
 
599 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  25.61 
 
 
492 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  23.12 
 
 
564 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
417 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
573 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  32.67 
 
 
506 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  31.3 
 
 
564 aa  45.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  32.67 
 
 
499 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
623 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  27.59 
 
 
568 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.76 
 
 
568 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.76 
 
 
568 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  29.41 
 
 
599 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
573 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.42 
 
 
749 aa  44.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
431 aa  44.3  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  24.43 
 
 
558 aa  44.3  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
868 aa  44.3  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  26.52 
 
 
589 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  30.67 
 
 
478 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
512 aa  43.9  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>