42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2548 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  80.54 
 
 		 442 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 442 aa  905    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.76 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.6 
 
 		 713 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.48 
 
 		 502 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.48 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.71 
 
 		 706 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.85 
 
 		 653 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.92 
 
 		 703 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.92 
 
 		 703 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.25 
 
 		 698 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.87 
 
 		 706 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.19 
 
 		 542 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.32 
 
 		 745 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.32 
 
 		 745 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  30.32 
 
 		 745 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.19 
 
 		 573 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.47 
 
 		 715 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.32 
 
 		 745 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.85 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.89 
 
 		 736 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.74 
 
 		 711 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.89 
 
 		 670 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.01 
 
 		 724 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.57 
 
 		 724 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.9 
 
 		 724 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.9 
 
 		 724 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.96 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  21.57 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 461 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  20.84 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 		 654 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  21.57 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  23.06 
 
 		 612 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0804  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  21.84 
 
 		 664 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>