145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3083 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  99.73 
 
 		 745 aa  1531    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  50.62 
 
 		 724 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  55.23 
 
 		 724 aa  712    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  50.21 
 
 		 724 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 745 aa  1533    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  99.46 
 
 		 745 aa  1529    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  50.48 
 
 		 724 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.03 
 
 		 736 aa  825    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  99.73 
 
 		 745 aa  1531    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.04 
 
 		 706 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.21 
 
 		 713 aa  452  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.76 
 
 		 706 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.86 
 
 		 715 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.87 
 
 		 698 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.11 
 
 		 573 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.11 
 
 		 653 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.88 
 
 		 703 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.88 
 
 		 703 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.12 
 
 		 497 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.67 
 
 		 502 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.03 
 
 		 502 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.76 
 
 		 542 aa  239  9e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.23 
 
 		 711 aa  217  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.52 
 
 		 670 aa  214  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.46 
 
 		 488 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.33 
 
 		 483 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  30.4 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  29 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 283 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 283 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  28.16 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  26.35 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  26.67 
 
 		 566 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  28.46 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  27.64 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 553 aa  62  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  30.86 
 
 		 871 aa  62  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  31.43 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  28.47 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  27.74 
 
 		 589 aa  60.1  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  27.74 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  33.33 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.01 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  27.74 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.37 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  27.64 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  28 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  34.26 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  25.85 
 
 		 277 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  27.41 
 
 		 571 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 570 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  30.43 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  29.27 
 
 		 561 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  26.49 
 
 		 574 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  26.19 
 
 		 576 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  24.43 
 
 		 568 aa  55.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  26.9 
 
 		 277 aa  55.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  23.97 
 
 		 564 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 891 aa  55.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.67 
 
 		 568 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  29.8 
 
 		 603 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 573 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  24.82 
 
 		 561 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  25.9 
 
 		 570 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.67 
 
 		 568 aa  55.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 573 aa  55.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  37.5 
 
 		 345 aa  54.3  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  29.92 
 
 		 564 aa  53.9  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 275 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  32.41 
 
 		 567 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.74 
 
 		 568 aa  53.9  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  28.26 
 
 		 569 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  26.24 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  25.09 
 
 		 885 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.57 
 
 		 568 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  36.46 
 
 		 345 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 686 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  28.68 
 
 		 378 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  27.11 
 
 		 281 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  27.21 
 
 		 585 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.09 
 
 		 563 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  28.57 
 
 		 577 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 280 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 280 aa  51.6  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  25 
 
 		 391 aa  51.6  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 280 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  27.14 
 
 		 367 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  24.68 
 
 		 787 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  26.76 
 
 		 554 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  30.77 
 
 		 574 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  25.55 
 
 		 577 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  30.91 
 
 		 578 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  24.09 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 888 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>