47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1755 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 670 aa  1338    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  52.75 
 
 		 542 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.63 
 
 		 711 aa  276  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  32.26 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.26 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.26 
 
 		 745 aa  231  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.42 
 
 		 745 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.84 
 
 		 713 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.75 
 
 		 736 aa  226  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.64 
 
 		 502 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.58 
 
 		 706 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.53 
 
 		 698 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.25 
 
 		 502 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.84 
 
 		 706 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.19 
 
 		 703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.19 
 
 		 703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.9 
 
 		 573 aa  219  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.96 
 
 		 653 aa  210  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.62 
 
 		 724 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.11 
 
 		 442 aa  206  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.94 
 
 		 724 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.77 
 
 		 715 aa  204  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.93 
 
 		 724 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.11 
 
 		 724 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  31.87 
 
 		 442 aa  201  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.68 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.03 
 
 		 483 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.24 
 
 		 488 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 626 aa  57.4  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 686 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 654 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  24.16 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 537 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 461 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  33.57 
 
 		 591 aa  48.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  29.47 
 
 		 1017 aa  47.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  26.52 
 
 		 664 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  25.06 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 789 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  24.84 
 
 		 606 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 789 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 789 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  29.17 
 
 		 575 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  24.15 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0804  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 430 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.38 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 616 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>