36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2724 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 497 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.89 
 
 		 706 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.58 
 
 		 706 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.38 
 
 		 653 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.79 
 
 		 713 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.68 
 
 		 715 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.46 
 
 		 698 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.96 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.65 
 
 		 573 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.78 
 
 		 703 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.78 
 
 		 703 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  38.12 
 
 		 745 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.12 
 
 		 745 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.12 
 
 		 745 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.04 
 
 		 745 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.43 
 
 		 724 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.78 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.56 
 
 		 502 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.77 
 
 		 724 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.29 
 
 		 724 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.24 
 
 		 724 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  33.76 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.02 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.56 
 
 		 488 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.11 
 
 		 483 aa  210  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.89 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.1 
 
 		 670 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.35 
 
 		 711 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.62 
 
 		 573 aa  53.5  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.62 
 
 		 630 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  24.63 
 
 		 612 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.43 
 
 		 656 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 537 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 509 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>