193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3618 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  80.8 
 
 		 698 aa  1160    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.07 
 
 		 653 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 703 aa  1449    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 703 aa  1449    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.18 
 
 		 706 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.93 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.77 
 
 		 713 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  48.17 
 
 		 573 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.77 
 
 		 715 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.52 
 
 		 736 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  38.75 
 
 		 745 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.75 
 
 		 745 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.75 
 
 		 745 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.92 
 
 		 745 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.73 
 
 		 724 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.68 
 
 		 724 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.78 
 
 		 497 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.56 
 
 		 724 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.99 
 
 		 724 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.05 
 
 		 502 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.66 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.95 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.84 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  30.84 
 
 		 542 aa  208  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  30.57 
 
 		 442 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.25 
 
 		 670 aa  196  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.63 
 
 		 483 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.45 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  28.49 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.35 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  37.21 
 
 		 559 aa  74.7  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 283 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  25.44 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  31.85 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.35 
 
 		 564 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  26.29 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  27.48 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  31.32 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  35.24 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  32.56 
 
 		 552 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 567 aa  67  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  38.4 
 
 		 574 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.71 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  36.75 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  31.58 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  27.66 
 
 		 573 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 567 aa  63.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.29 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 585 aa  62.4  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.18 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  27.96 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  30.92 
 
 		 552 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 553 aa  62  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.03 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  29.28 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  29.66 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  37.86 
 
 		 244 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  29.29 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.58 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  31.25 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  35.46 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0872  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway PilB-like  27.73 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  35.46 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  35.59 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  35.96 
 
 		 367 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  28.29 
 
 		 568 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  36.62 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  35 
 
 		 345 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 340 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  34.15 
 
 		 565 aa  56.2  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  35 
 
 		 571 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.53 
 
 		 553 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  41.54 
 
 		 577 aa  55.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  51.85 
 
 		 891 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.71 
 
 		 871 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  27.66 
 
 		 577 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 573 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  31.3 
 
 		 587 aa  55.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 545 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  28.79 
 
 		 594 aa  55.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  23.31 
 
 		 561 aa  55.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  30.57 
 
 		 578 aa  54.7  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3220  General secretory system II protein E domain protein  28.14 
 
 		 550 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.35 
 
 		 568 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  28.35 
 
 		 568 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 555 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  29.94 
 
 		 550 aa  54.3  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.35 
 
 		 568 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>