47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0567 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  57.97 
 
 		 713 aa  763    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  59.43 
 
 		 706 aa  835    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  59.29 
 
 		 706 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  62.75 
 
 		 573 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 715 aa  1464    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.77 
 
 		 703 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.77 
 
 		 703 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.65 
 
 		 698 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.99 
 
 		 653 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.47 
 
 		 736 aa  465  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  38.45 
 
 		 745 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.45 
 
 		 745 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.45 
 
 		 745 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.59 
 
 		 745 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.11 
 
 		 724 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.06 
 
 		 724 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.59 
 
 		 724 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.36 
 
 		 724 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.56 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.77 
 
 		 502 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.34 
 
 		 502 aa  327  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.76 
 
 		 542 aa  231  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.33 
 
 		 442 aa  230  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.13 
 
 		 488 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.41 
 
 		 483 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  33.55 
 
 		 442 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.63 
 
 		 711 aa  213  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.18 
 
 		 670 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 461 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.79 
 
 		 532 aa  55.8  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 686 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 431 aa  51.2  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  24.16 
 
 		 698 aa  50.8  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.02 
 
 		 656 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 553 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  33.62 
 
 		 636 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 564 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 564 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.43 
 
 		 568 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 899 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 555 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 568 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  34.15 
 
 		 638 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 626 aa  44.3  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  25.18 
 
 		 612 aa  44.3  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.43 
 
 		 568 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 556 aa  43.9  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>