47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2644 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 488 aa  978    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  46.97 
 
 		 483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.78 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.29 
 
 		 703 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.29 
 
 		 703 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.63 
 
 		 706 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.06 
 
 		 706 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.64 
 
 		 715 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.9 
 
 		 573 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.82 
 
 		 698 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.53 
 
 		 736 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.53 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.53 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.12 
 
 		 713 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.66 
 
 		 745 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  33.66 
 
 		 745 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.66 
 
 		 745 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.38 
 
 		 653 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.66 
 
 		 745 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.24 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  34.62 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.25 
 
 		 724 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  31 
 
 		 724 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.46 
 
 		 724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.47 
 
 		 724 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  31.08 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.14 
 
 		 711 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.46 
 
 		 670 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.2 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  26.05 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.27 
 
 		 573 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.91 
 
 		 630 aa  53.5  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  26.94 
 
 		 673 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 686 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 626 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.92 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 512 aa  47.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  24.51 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 917 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  22.85 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>