68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1309 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  100 
 
 		 542 aa  1110    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  53.08 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.62 
 
 		 711 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.39 
 
 		 745 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.39 
 
 		 745 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  33.39 
 
 		 745 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.21 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.63 
 
 		 736 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.15 
 
 		 715 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.88 
 
 		 698 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.46 
 
 		 713 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.4 
 
 		 706 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.21 
 
 		 706 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.6 
 
 		 442 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.08 
 
 		 502 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.51 
 
 		 653 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  35 
 
 		 502 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.84 
 
 		 703 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.16 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.84 
 
 		 703 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.89 
 
 		 497 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.43 
 
 		 724 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  32.88 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.73 
 
 		 724 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.78 
 
 		 724 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.72 
 
 		 724 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.25 
 
 		 483 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.94 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  26.52 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  25.95 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 654 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  23.54 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 664 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  22.35 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.83 
 
 		 573 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  22.99 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  24.62 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  23.18 
 
 		 475 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  22.99 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  23.11 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 626 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  21.85 
 
 		 606 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.44 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0804  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 430 aa  50.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  24.73 
 
 		 635 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 		 652 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.33 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 		 509 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  22.84 
 
 		 624 aa  47  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 642 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 806 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 650 aa  43.9  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>