146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2524 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  58.17 
 
 		 745 aa  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  52.25 
 
 		 724 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 736 aa  1491    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  48.65 
 
 		 724 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.03 
 
 		 745 aa  844    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.17 
 
 		 745 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  48.74 
 
 		 724 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.17 
 
 		 745 aa  852    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  48.59 
 
 		 724 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.3 
 
 		 706 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.8 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.66 
 
 		 713 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.19 
 
 		 715 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.35 
 
 		 698 aa  426  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.52 
 
 		 703 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.52 
 
 		 703 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.42 
 
 		 573 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.05 
 
 		 653 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.96 
 
 		 497 aa  335  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  37 
 
 		 502 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.79 
 
 		 502 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.63 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.15 
 
 		 488 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.04 
 
 		 670 aa  210  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.79 
 
 		 483 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.03 
 
 		 711 aa  204  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.75 
 
 		 442 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  29.22 
 
 		 442 aa  180  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  34.35 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  28.28 
 
 		 561 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.89 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  30.07 
 
 		 566 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  30 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.59 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  26.67 
 
 		 871 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 283 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  32.89 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 557 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  33.1 
 
 		 561 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  39.64 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.93 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 568 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.92 
 
 		 568 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.93 
 
 		 568 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.92 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.21 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.61 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 553 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  32.54 
 
 		 612 aa  60.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  30.28 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  27.52 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  30.56 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  26.85 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  36.61 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  27.82 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.48 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  31.3 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  35.14 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  26.13 
 
 		 576 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 559 aa  57  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 573 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  30.2 
 
 		 571 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.34 
 
 		 568 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 568 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  27.39 
 
 		 585 aa  55.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 891 aa  55.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 552 aa  55.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  31.29 
 
 		 569 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  35.25 
 
 		 425 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  37.3 
 
 		 367 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  35.71 
 
 		 426 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  30.17 
 
 		 577 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  29.27 
 
 		 568 aa  52.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 561 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  34.34 
 
 		 574 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  25.58 
 
 		 570 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  28.46 
 
 		 586 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  27.59 
 
 		 552 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  31.3 
 
 		 573 aa  51.6  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  32 
 
 		 574 aa  51.2  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  34.07 
 
 		 345 aa  51.2  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  25.2 
 
 		 888 aa  51.2  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  23.15 
 
 		 476 aa  50.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  26.94 
 
 		 885 aa  50.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  24.84 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  30.66 
 
 		 385 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  24.68 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  26.24 
 
 		 589 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  40.21 
 
 		 1017 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>