92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1734 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  57.97 
 
 		 715 aa  761    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  56.24 
 
 		 706 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  56.3 
 
 		 706 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.94 
 
 		 573 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 713 aa  1437    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.34 
 
 		 698 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.77 
 
 		 703 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.77 
 
 		 703 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.53 
 
 		 653 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.33 
 
 		 736 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  41.09 
 
 		 745 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.95 
 
 		 745 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.09 
 
 		 745 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.57 
 
 		 745 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.22 
 
 		 724 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.6 
 
 		 724 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.28 
 
 		 724 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.95 
 
 		 724 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.51 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.3 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.74 
 
 		 502 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.56 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.52 
 
 		 542 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  31.89 
 
 		 442 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.4 
 
 		 711 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.64 
 
 		 670 aa  216  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.68 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.41 
 
 		 483 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  31.69 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 571 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  34.29 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 564 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  33.57 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.06 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 573 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  33.58 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  31.63 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 553 aa  56.2  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 561 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 558 aa  55.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 568 aa  54.3  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  30.46 
 
 		 568 aa  54.3  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.57 
 
 		 568 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  29.59 
 
 		 567 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  30.3 
 
 		 547 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  35.38 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  30 
 
 		 561 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 553 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 888 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.99 
 
 		 568 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 555 aa  51.2  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 572 aa  50.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 574 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  28.99 
 
 		 568 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.43 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  32.38 
 
 		 648 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.46 
 
 		 571 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0349  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 638 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000754733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 283 aa  48.9  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 461 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  34.19 
 
 		 871 aa  47.4  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  25.89 
 
 		 385 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  32.67 
 
 		 182 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 636 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 576 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  26.32 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  35.9 
 
 		 578 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  29.06 
 
 		 610 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  26.76 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  29.13 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  30.09 
 
 		 587 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  28.1 
 
 		 577 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  27.83 
 
 		 553 aa  45.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  29.8 
 
 		 578 aa  45.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  33.06 
 
 		 181 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  23.76 
 
 		 569 aa  44.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.62 
 
 		 568 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  34.78 
 
 		 181 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.62 
 
 		 568 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 558 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  23.78 
 
 		 563 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  26.81 
 
 		 566 aa  44.3  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  33.33 
 
 		 577 aa  44.3  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 283 aa  44.3  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  28.35 
 
 		 391 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>