38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3312 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  80.54 
 
 		 442 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 442 aa  907    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.68 
 
 		 713 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.38 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.02 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.38 
 
 		 502 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  35.6 
 
 		 542 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.26 
 
 		 698 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.84 
 
 		 703 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.84 
 
 		 703 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.62 
 
 		 573 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  34.49 
 
 		 715 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.14 
 
 		 706 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.4 
 
 		 653 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.75 
 
 		 736 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  30 
 
 		 706 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.78 
 
 		 745 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.78 
 
 		 745 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  28.78 
 
 		 745 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.27 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  29 
 
 		 745 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.43 
 
 		 670 aa  182  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.87 
 
 		 711 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.76 
 
 		 724 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  29.42 
 
 		 724 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.09 
 
 		 724 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.58 
 
 		 724 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.9 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  22.72 
 
 		 604 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  24.08 
 
 		 628 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  22.72 
 
 		 636 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 654 aa  50.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 		 848 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 917 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  23.47 
 
 		 698 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  24.17 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>